A Text Database Management System SIGMA and Its Applications to Analyzing the Genetic Information

SIGMAは, 著者らが開発し九州大学大型計算機センターで1981年から公開しているテキストデータペース管理システムであり, フルテキストデータベースの高速検索に活用されている. ゲノムデータベースは, 複雑なフォーマットを有し, 長大な配列情報を含むため, テキストデータペース化しフルテキストサーテを行うことは, ゲノム解析に有効である. 簡単なデータ変換を行うことにより, 遺伝子塩基配列データベースGen Bank, タンパク質アミノ酸配列データベースPIRを, SIGMAで管理・検索できることを確認したので報告する.

Genome Informatics

Japanese Society for Bioinformatics

0919-9454

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