マイクロRNA前駆体におけるRNA編集部位の解析

日本学術振興会

科学研究費助成事業 基盤研究(C)

新潟薬科大学

川野 光興
マックスウェル バローズ

基盤研究(C)

https://kaken.nii.ac.jp/file/KAKENHI-PROJECT-26430187/26430187seika.pdf

miRNA前駆体の網羅的な発現解析は、miRNA前駆体と全長が近いsnoRNAが細胞内に大量に存在するために困難となっている。ヒト脳サンプルを用いたmiRNA前駆体の次世代シーケンシング解析において、新規のDNA/LNAオリゴを用いることによりsnoRNAの割合を低下させることができ、miRNA前駆体リード総数を増やすことができた。その結果miRNA前駆体上に生じたRNA編集部位を複数箇所発見することができた。さらに、let-7ファミリーを特異的に減弱できるDNA/LNAオリゴを作製して次世代シーケンス解析を行ったところ、let-7ファミリー以外のmiRNAリードカウントを上げることができた。